Esta Fundación, que nació en 1999, tiene por finalidad conservar y difundir la inspiración, talante, trabajo y sabiduría, del Comandante Cousteau, con el apoyo de su hijo Philippe Cousteau. La Fundación se estableció en España, con el objetivo de transmitir a las futuras generaciones la importancia de proteger Mares y Océanos.
Igualmente, la Fundación Philippe Cousteau, tiene como objetivo promover y concienciar por la conservación de la mar y el medio ambiente, así como el desarrollo de la solidaridad entre los pueblos del mar.